Les appartenances typologiques des affluents du Viaur se situent dans la zone salmonicole et la zone mixte. Le caractère salmonicole des cours d'eau est dominant et la majorité des cours d'eau présente des caractéristiques typologiques proches de l'optimum pour la truite Fario. La zone mixte est localisée sur les cours aval du Giffou, du Céor et du Lézert.
Sur le Viaur on observe une évolution longitudinale naturelle des potentialités piscicoles. Cette évolution longitudinale subit les modifications induites par la présence des retenues de Pont de Salars, de Pareloup et de Thuriès sur le régime thermique du Viaur.

les eaux à vocations salmonicoles, à l'amont de la retenue de Pont de Salars et à L'aval de cette retenue jusqu'à la confluence avec le Vioulou (la restitution du débit réservé par vanne de fond maintient la vocation salmonicole sur le parcours)
les eaux, à vocations cyprinicoles, dans la partie basse du Viaur, à l'aval de la confluence avec le Céor
entre ces deux espaces, aux potentialités clairement définies, s'intercale une zone à vocation salmonicole mais perturbée par la réduction du débit du Viaur et du Vioulou. Le réchauffement rapide des eaux en période estivale favorise une cyprinisation du cours d'eau.
D'autre part, des populations d'écrevisses à pattes blanches ont été recensées sur des affluents et sous affluents du Viaur.

